解读结块性皮肤疾病的遗传景观:通过在印度进行全面的基因组序列分析,揭示可变病毒性
R Mishra1, S K Biswas1, S Nandi1
1Center for Animal Disease Research and Diagnosis, ICAR-Indian Veterinary Research Institute, Izatnagar, Bareilly, UP, 243122, India.
Virology
|May 28, 2024
概括
印度的皮病 (LSD) 已经演变,在牛群中发现了新的遗传变异. 这些遗传转变,包括特定的基因删除,可能解释了最近爆发期间观察到的疾病严重程度的变化.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 分子流行病学分子流行病学
- 动物卫生 动物健康
背景情况:
- 凸起性皮肤病 (LSD) 是一种影响牛的显著的天花病毒,在2019年在印度出现.
- 这种疾病在2022年加剧,给奶牛农造成了巨大的经济损失.
- 在2022年爆发期间观察到死亡率和发病率模式的异常转变.
研究的目的:
- 为了对2019年至2022年在印度流传的块性皮肤病病毒 (LSDV) 菌株进行全面的遗传分析.
- 研究遗传变异及其与观察到的疾病模式变化的潜在相关性.
- 识别与毒性和临床表现相关的特定遗传标记.
主要方法:
- 对2019年至2022年期间从牛群中采集的LSDV样本的分析.
- 遗传学分析以识别不同的病毒亚类.
- 基因分析,包括Ankyrin重复和特定基因删除 (GPCR,FRS重复).
主要成果:
- 印度两种不同的LSDV亚分类 (1.2a和1.2b) 的流通,其中亚分类1.2b与疾病和死亡率的改变有关.
- 安基林重复基因分析根据临床分数区分动物.
- 识别独特的遗传变异,包括GPCR基因中的12核酸删除和功能分辨序列 (FRS) 中的95核酸删除在2022个孤立中重复,在2019个菌株中不存在.
结论:
- 印度LSDV的遗传景观已经演变,出现了不同的子类和新的删除.
- 这些遗传变化,特别是GPCR和FRS重复中的缺失,可能导致最近印度疫情中观察到的病毒毒性增加和疾病模式改变.
- 需要进一步的研究,以充分阐明这些遗传变异对LSDV病原体的影响.
