识别潜在的乳腺癌干细胞生物标志物在分泌体使用网络交互方法分析分析
Ay Ly Margaret1, Septelias Inawati Wanandi2,3, Fadilah Fadilah4
1Doctoral Program in Biomedical Sciences, Faculty of Medicine, Universitas Indonesia, Jl. Salemba Raya No. 6, Jakarta, 10430, Indonesia.
Asian Pacific journal of cancer prevention : APJCP
|May 29, 2024
概括
这项研究确定了乳腺癌干细胞 (BCSC) 的潜在生物标志物,以改善诊断和治疗. FYN,INADL,OCLN,F11R和TOP2A可以作为BCSC的关键指标.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 乳腺癌干细胞 (BCSCs) 与治疗耐药性,复发和转移有关.
- 对BCSCs的准确生物标志物对于癌症识别,预后,诊断和治疗监测至关重要.
研究的目的:
- 进行全面的生物信息分析,以预测BCSCs的特定生物标志物.
- 识别与BCSCs相关的关键基因和途径.
主要方法:
- 使用了基因表达大巴 (GEO) 的基因表达数据集 (GSE7513,GSE7515).
- 使用Enrichr (基因本体学,Reactome路径) 进行功能丰富分析.
- 使用Cytoscape和STRING构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络,以识别枢纽基因.
主要成果:
- 在BCSC中确定了65个上调和190个下调的差异表达基因 (DEGs).
- GO分析揭示了参与瘤发生和茎形成的DEGs,包括细胞外基质修饰,细胞骨重组,粘附,运动,迁移,生长和生存.
- 反应体分析显示,DEG与ECM功能,癌症代谢,血管新生,瘤生长,扩散和转移有关.
结论:
- 鉴定出一个潜在的生物标记面板BCSCs从分泌体:FYN,INADL,OCLN,F11R和TOP2A.
- 这些生物标志物可以帮助精确识别和治疗乳腺癌.
- 这项研究强调了生物信息学方法在发现癌症干细胞生物标志物的有用性.
