在乳腺状甲状腺癌淋巴结转移中的血清外体圆形RNA的表达形状和生物信息学分析
Huiyong Peng1,2,3, Zhangwei Zhu4, Jie Xing3
1Department of Environmental Genomics, Jiangsu Key Laboratory of Cancer Biomarkers, Prevention and Treatment, Collaborative Innovation Center for Cancer Personalized Medicine, School of Public Health, Nanjing Medical University, Nanjing, Jiangsu 2211166, China.
这项研究确定了异常的外体循环RNA (circRNAs),与乳腺状甲状腺癌 (PTC) 中的淋巴结转移 (LNM) 有关. 这些发现为预测PTC进展和LNM提供了潜在的生物标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 乳头甲状腺癌 (PTC) 一般具有良好的预后.
- 淋巴结转移 (LNM) 是PTC常见的进展,往往导致较差的结果.
- 在PTC中驱动LNM的分子机制仍未得到充分探索.
研究的目的:
- 调查外体循环RNAs (circRNAs) 在乳头甲状腺癌淋巴结转移 (PTC-LNM) 中的作用.
- 在PTC患者中识别与LNM相关的潜在circRNA生物标志物.
主要方法:
- 来自带有和没有LNM的PTC患者的外体环RNA的分析.
- 对circRNA-miRNA-mRNA网络进行生物信息选.
- 对异常表达的circRNAs的功能丰富分析.
- 验证特定的circRNA介导通路和枢纽基因.
主要成果:
- 在LNM的PTC患者中鉴定了9000个异常表达的外体环RNA (684个上调,2193个下调).
- 丰富分析揭示了与PTC进展和LNM相关的途径.
- 选了14个circRNA-miRNA-mRNA网络,其中circTACC2-miR-7-EGFR和circBIRC6-miR-24-3p-BCL2L11轴被突出显示.
- 鉴定与失调的circRNAs相关的枢纽基因,其中一些涉及到LNM.
结论:
- 外体环RNA在乳头甲状腺癌中LNM的发展中起着重要作用.
- 失调的circRNA及其网络代表了PTC-LNM的潜在诊断和预后生物标志物.
- 这项研究为进一步研究 PTC 进展中的外osomal circRNAs 提供了框架.
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