基于线粒体RNA修饰的签名来预测较低等级质瘤的预后:一个多omics探索和验证研究
Xingwang Zhou1, Yuanguo Ling1, Junshuan Cui1
1Department of Neurosurgery, The Affiliated Hospital of Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou Province, People's Republic of China.
Scientific reports
|June 1, 2024
概括
线粒体RNA修饰 (MRM) 在低级质瘤 (LGGs) 中至关重要. 一个新的MRM得分预测了预后和治疗反应,为LGG提供了潜在的治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 线粒体RNA修饰 (MRM) 调节基因表达并促进瘤转移.
- 在低级质瘤 (LGGs) 中MRM的作用尚不清楚.
- 需要对LGG微环境中的MRM进行全面分析.
研究的目的:
- 调查LGG中MRM相关基因的分布,功能状态和相关性.
- 开发一种MRM评分系统,用于预测LGG的预后和治疗反应.
- 探索MRM作为LGG治疗点的潜力.
主要方法:
- 使用单细胞RNA-seq数据 (GSE89567) 进行LGG微环境分析.
- 在大量RNA-seq数据集 (TCGA,CGGA,GSE16011,E-MTAB-3892) 上使用LASSO回归和随机生存森林开发了一个MRM评分系统.
- 通过qPCR验证了MRM基因,并进行了评估METTL8沉默的体外实验.
主要成果:
- 与正常组织相比,在LGG中确定了22个上调和10个下调的MRM相关基因.
- 建立了一个6基因MRM评分系统 (TRMT2B,TRMT11,METTL6,METTL8,TRMT6,TRUB2),可以预测临床特征,免疫透和结果.
- 证明沉默METTL8抑制质瘤细胞增殖并增强细胞亡;高MRM得分与更好的免疫疗法和小分子药物反应相关.
结论:
- 在LGG微环境中,MRM起着重要的作用,影响恶性病变的进展.
- 开发的MRM评分系统是预测LGG预后和治疗疗效的宝贵工具.
- 对于LGG来说,MRM是制定精确的免疫治疗策略的有希望的目标.


