对多种转录基因方法和机器学习集成算法的综合分析揭示了高内皮静脉作为膀癌的预后免疫相关生物标志物
Jinge Zhang1, Yuan Huang1, Xing Tan2
1Department of Urology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, Guangdong 510515, PR China.
International immunopharmacology
|June 2, 2024
概括
高内皮静脉 (HEV) 预测膀癌的免疫治疗反应. 向LDLRAD3可能通过促进HEV生成以改善患者预后来提高治疗效果.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 尽管现有疗法,但膀癌 (BCa) 治疗仍然具有挑战性.
- 免疫疗法是有前途的,但它只对一小部分患者有益.
- 确定新的点对于提高免疫疗法疗效至关重要.
研究的目的:
- 研究高内皮静脉 (HEV) 在膀癌免疫治疗中的作用.
- 识别用于增强免疫疗法反应的新型分子标.
主要方法:
- 在转录基因数据 (空间,批量,scRNA-seq) 上进行HEV ssGSEA分析.
- 使用R包识别与HEV相关的基因 (HEV.RGs).
- 分子亚型化,使用机器学习算法进行预测模型构建.
- 在临床前模型中验证LDLRAD3.
主要成果:
- 在接受免疫治疗的BCa患者中,较高的HEV水平与更好的免疫反应和预后相关.
- 根据HEV.RGs,BCa患者被分为两种分子,显示出明显的生存率和免疫透率.
- 较低的LDLRAD3表达与HEV生成和潜在增强的免疫疗法疗效有关.
结论:
- HEV是免疫治疗反应和膀癌的预后预测生物标志物.
- LDLRAD3是诱导HEV和改善免疫治疗结果的潜在治疗标.
