合并代谢建模和成像,用于查结肠直肠癌治疗标

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 系统生物学 系统生物学
• 代谢工程是代谢工程.

背景情况:

• 癌症相关纤维细胞 (CAF) 是结直肠癌 (CRC) 代谢重编程的关键驱动因素.
• CAFs对CRC的耐药性有显著的贡献,需要新的治疗策略.
• 了解CAF和CRC细胞之间的代谢交叉是开发有效治疗方法的关键.

研究的目的:

• 识别和验证CRC-CAF代谢交叉连接中的关键代谢标.
• 使用基于机器学习的方法和CRC代谢模型,以计算方式选酶扰动.
• 实验验证针对患者衍生瘤器官中发现的代谢漏洞的有效性.

主要方法:

• 综合系统生物学方法结合了计算建模和实验验证.
• 基于机器学习的新型方法,用于对酶扰动进行高通量计算选.
• 使用患者衍生瘤器官 (PDTO),代谢成像和生命力测试进行实验验证.

主要成果:

• 赫索金酶 (HK) 通过计算查被确定为一个关键的代谢标.
• 在CAF调节介质中培养的PDTOs对HK抑制的敏感性增加.
• 实验结果证实了模型对HK作为可行的治疗目标的预测.

结论:

• 整合计算和实验技术对于探索和利用CRC-CAF代谢交叉对讲是必不可少的.
• 向赫索金酶是克服结肠直肠癌药物耐药性的有希望的策略.
• 这种方法为癌症治疗中的代谢标的数据驱动识别和验证提供了一个框架.