基于转录组学和蛋白组学分析的素吸收肺损伤的特征
Li-Na Wang1, Yi-Ru Shao2,3,4, Peng-Fei Wang2,3
1Department of General Practice, Jinshan Hospital, Fudan University, Shanghai, China.
Frontiers in genetics
|June 3, 2024
概括
素肺损伤涉及改变基因表达,特别是在神经元通路和炎症. 了解这些分子变化为治疗素诱导肺损伤 (P-ALI) 提供了新的途径.
科学领域:
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 素是一种广泛使用的化学物质,对其病理性损伤没有有效的解药.
- 肺组织中的神经元炎症与素诱导的肺损伤 (P-ALI) 有关,但机制尚不清楚.
研究的目的:
- 在P-ALI之后分析肺组织中整个转录组和蛋白质组的改变.
- 确定影响P-ALI预后的关键因素和途径.
主要方法:
- 建立了P-ALI的老鼠模型,并与对照组进行了比较.
- 肺损伤通过组织学和湿/干比进行评估;炎症因素通过ELISA测量.
- 高通量测序和无标签蛋白质组学被用于基因和蛋白质表达概况.
主要成果:
- P-ALI诱导了显著的肺结构损伤和升高的炎症因子 (IL-1β,IL-18,IL-33).
- 转录组分析揭示了许多差异表达的lncRNAs,circRNAs和miRNAs,主要影响神经元和代谢途径.
- 蛋白质组分析确定了79种参与N-甘氨酸生物合成的差异表达蛋白质.
结论:
- 不同表达的基因 (lncRNAs,circRNAs,miRNAs) 与神经元反射,突触信号传递和炎症/代谢途径有关.
- 这些发现表明P-ALI治疗和预后的新分子标.
- 对这些已识别的途径进行进一步的研究是有必要的.
