作为乳腺癌免疫相关生物标志物的UBE2C:基于多个数据库的研究
Yue Cui1, Hong-Zhi Wang1, Ye Song1
1Central Laboratory of the Fifth Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Daqing 163711, Heilongjian Province, China.
概括
在乳腺癌 (BRCA) 中,UBE2C基因被上调,预测生存率较低. 高UBE2C表达与免疫性较低的瘤微环境相关,这表明它有可能作为BRCA患者的预后生物标志物和免疫疗法的有效性.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 乳腺癌 (BRCA) 存活率受到复杂的遗传和免疫因素的影响.
- 识别新的预后生物标志物对于改善BRCA患者的治疗结果至关重要.
研究的目的:
- 选与BRCA存活相关的目标基因.
- 探索BRCA中确定的基因的预后价值和免疫相关性.
主要方法:
- 来自基因表达大巴 (GEO) 的BRCA数据集的差异基因表达分析.
- 蛋白质与蛋白质相互作用网络的构建,以识别枢纽基因.
- 使用癌症基因组图谱 (TCGA) 和qRT-PCR验证关键基因表达.
- 使用TIMER和GSEA进行预后分析和免疫相关性探索.
主要成果:
- UBE2C被确定为与BRCA存活相关的关键基因,显示BRCA组织中的差异上调.
- 高UBE2C表达是一个独立的预后因素,与免疫细胞透率降低有关,与免疫检查点基因相关.
- UBE2C表达与瘤突变负担和微卫星不稳定性正相关,免疫相关基因组的显著丰富.
结论:
- UBE2C表达与BRCA免疫微环境密切相关.
- UBE2C对BRCA患者的生存,预后和免疫疗法的有效性具有预测价值.
- UBE2C可以作为乳腺癌潜在的免疫相关预后生物标志物.
