基于混合染料的双阶段异热放大与核糖核酶可切割的增强探针用于双可视化检测SARS-CoV-2感兴趣的变种
Xiong Ding1, Yaru Wang1, Yuxin Gui1
1Key Laboratory of Environmental Medicine and Engineering, Ministry of Education, Department of Nutrition and Food Hygiene, School of Public Health, Southeast University, Nanjing, 210009, P. R. China.
概括
一种新的REP-TMAP试验可快速,可视地检测SARS-CoV-2变种,如JN.1. 该方法使用颜色和光变化来快速识别特定变异,帮助全球卫生监测.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 病毒学 病毒学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 快速和可视检测SARS-CoV-2变种对于管理传播至关重要,特别是在资源有限的地区.
- 现有的方法可能缺乏对点护理应用所需的速度,灵敏度或视觉反.
研究的目的:
- 开发一种新的,快速的,可视检测的SARS-CoV-2变种测试方法.
- 通过使用单一的闭管系统,同时识别感染和特定变种类型.
主要方法:
- 开发了一种两阶段的混合染料异热放大方法,使用可分割的核糖核酶增强探针 (REP-TMAP).
- 使用逆转录重组酶聚合酶放大,然后使用REP和混合染料 (克雷索红色,氧纳蓝色) 进行双可视化检测.
- 评估了SARS-CoV-2尖端基因RNA的检测,变体特异性,敏感性和临床性能.
主要成果:
- REP-TMAP在40分钟内提供高灵敏度 (10-200副本/反应) 和特异性的结果,检测单基突变.
- 视觉颜色变化表明SARS-CoV-2感染;在蓝光下的光变化区分了变种 (JN.1,BA.2,BA.4/5,Delta).
- 临床验证使用102个口腔口拭子证实了对JN.1,BA.2和BA.4/5变种的准确检测.
结论:
- REP-TMAP为SARS-CoV-2变种检测提供了一种快速,灵敏和特定的双可视化方法.
- 该试验适合于护理场所的使用,特别是在资源有限的环境中.
- 这项技术有可能在传染病诊断中得到更广泛的应用.
