胆道分析仪:一个开源的,端到端的管道用于光学连贯断层扫描中的胆道分析

科学领域:

• 眼科和医学成像学
• 医疗保健中的人工智能
• 生物医学图像分析

背景情况:

• 精确细分胆膜及其血管系统对于了解各种眼睛疾病至关重要.
• 手动对胆道结构进行细分是耗时的,容易引起观察者之间的变化.
• 现有的自动化方法往往缺乏对胸膜厚度,面积和血管性的全面分析.

研究的目的:

• 开发 Choroidalyzer,这是一个开源的,端到端的管道,用于自动细分胆道.
• 为了能够从OCT B扫描中精确地推导出胸膜厚度,面积和血管指数.
• 为了验证 Choroidalyzer 与手动细分和分级的性能.

主要方法:

• 利用了来自233名受试者的5600个OCTB扫描数据集,这些数据来自不同的队列和设备.
• 采用最先进的自动方法进行手动校正,用于基准真相生成.
• 训练了一种U-Net深度学习模型,用于对胆道区域,血管和膜进行细分.

主要成果:

• 胆氧化剂显示出优异的区域细分 (Dice:0.9789内部,0.9749外部) 和叶局部化 (MAE:3.4外部像素).
• 获得了非常好的血管细分性能 (Dice:0.8703外部) 和胆道指标的高相关性 (Pearson r > 0.79).
• 在所有指标上,与手动评分员达成的绩效协议与各级之间达成的协议相当.

结论:

• 冠状腺分析器提供了一个准确可靠的开源解决方案,用于冠状腺分析.
• 该管道提供了客观性和标准化,特别是在具有挑战性的胆道血管细分任务中.
• 这种自动化方法可以显著推进对影响胆膜的全身性疾病的研究.