完全光学电压成像指导的突触后单细胞转录基因组简介与电压-Seq

科学领域:

• 神经科学是一个神经科学.
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 遗传学 是一个

背景情况:

• 神经路径利用不同的突触后反应类型 (PRT) 来维持连接.
• 基于PRT进行单细胞RNA测序的神经元的选择此前受到低通量电生理学的限制.

研究的目的:

• 开发一种基于单细胞RNA测序的特定PRT针对神经元的高通量方法.
• 为了使神经元连接和基因表达在特定细胞类型内的详细分析.

主要方法:

• 开发了Voltage-Seq,利用在小鼠大脑切片中遗传编码的电压指示器Voltron.
• 创建了VoltView,这是一个带有分类器的分析工具,用于指导 soma 收集特定的 PRT.
• 准备光路的详细程序,成像,分析和测序库的准备.

主要成果:

• 电压-Seq使高通量全光学突触测定和从选定的突触后神经元中获取单细胞转录组数据成为可能.
• 该方法允许解决连接率的比例,并探索连接组内的PRT多样性.
• 以细胞类型特定的方式,促进研究连接性和基因表达之间的相关性.

结论:

• 电压Seq为研究神经元连接和基因表达提供了一种强大的高通量方法.
• 这种技术克服了以前的局限性,为后突触反应类型的多样性提供了新的见解.
• 能够对激发性和抑制性连接及其与基因表达的关系进行细胞类型特定的分析.