通过综合分析,在系统性红斑狼中构建竞争的内源性RNA网络
Juanjuan He1,2, Yunfeng Dai1,2, Jianwen Liu1,2
1Fujian Medical University Shengli Clinical Medical College, Fuzhou, China.
Frontiers in medicine
|June 5, 2024
概括
这项研究揭示了系统性红斑狼 (SLE) 中一种新的竞争性内源性RNA (ceRNA) 网络. 这些发现表明,ceRNA网络在SLE病变发生过程中起着关键作用,并提供潜在的治疗点.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 系统性红斑狼 (SLE) 是一种自身免疫性疾病,其特征是免疫性炎症和多器官损伤.
- 竞争的内源RNAs (ceRNAs) 已与狼有关,但它们的精确调节机制尚不清楚.
- 了解ceRNA网络的作用对于阐明SLE病理生理学至关重要.
研究的目的:
- 调查SLE中ceRNA网络的调控功能.
- 通过ceRNA分析,识别参与SLE病变的关键途径和分子.
主要方法:
- 来自患者样本和公共数据集 (GEO) 的circRNAs,miRNAs和mRNAs的差异表达分析.
- 使用生物信息学工具 (miRMap,miRanda,Cytoscape) 构建一个circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络.
- 通过蛋白质-蛋白质相互作用网络识别枢纽基因并分析免疫细胞透 (CIBERSORT,GSEA).
主要成果:
- 在SLE患者中鉴定了230个重叠的circRNA,86个差异表达的miRNA (DEmiRNA) 和2083个差异表达的mRNA (DEmRNA).
- 构建一个包含11个circRNA,9个miRNA和51个mRNA的ceRNA网络.
- 确定ESR1和SIRT1作为关键的枢纽基因,富含FoxO信号,脂质和动脉样硬化途径.
结论:
- 一个新的circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络 (HSA_circ_0000345-HSA_miR-22-3-P-ESR1/SIRT1) 被确定,可能会影响SLE.
- 这项研究表明,ceRNA网络在SLE病变发生过程中起着重要的调节作用.
- 这些发现为SLE的潜在治疗策略提供了洞察力.
