为检测SARS-CoV-2而进行的一步低成本分子测试,适合社区测试,使用最小加工的唾液
Sofia M da Silva1, Catarina Amaral1, Cláudia Malta-Luís1
1Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Universidade Nova de Lisboa, Oeiras, 2780-157, Portugal.
Biology methods & protocols
|June 5, 2024
概括
使用SYBR绿色染料的逆转录聚合酶连锁反应 (RT-PCR) 的新型,经济高效的唾液测试为检测SARS-CoV-2提供了可靠的替代方案. 这种侵入性较小的方法适用于大规模社区查,可以识别变异.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 诊断2019年冠状病毒病 (COVID-19) 的黄金标准涉及RNA提取和反转录-聚合酶链反应 (RT-PCR) 使用化探针.
- 这种成熟的方法虽然准确,但成本高昂,使用侵入性鼻口腔抹布,限制了它在广泛的公共卫生查中的实用性.
- 需要更容易获得,更具成本效益,更少侵入性的诊断工具来进行大规模的传染病监测.
研究的目的:
- 开发和验证一种新型的一步RT-PCR测试,使用DNA插曲染料SYBR绿色检测SARS-CoV-2.
- 评估使用唾液作为本RT-PCR试验的样本类型的可行性,旨在采用一种不那么侵入性的采集方法.
- 评估该测试的识别SARS-CoV-2变异的能力及其在现实世界大规模查环境中的表现.
主要方法:
- 使用SYBR绿色染料开发了一步RT-PCR试验,用于从唾液或鼻 (NP) 拭子中直接检测SARS-CoV-2RNA.
- 评估了测试的灵敏度,特异性和区分SARS-CoV-2变体的能力.
- 开发的唾液RT-PCRSYBR绿色测试是在大规模查计划中实施的,涉及大约4500名无症状儿童.
主要成果:
- 基于SYBR绿色的RT-PCR测试证明了从唾液和NP拭子中可靠地检测SARS-CoV-2,与黄金标准相比.
- 该测试可以优化,以区分SARS-CoV-2变种之间的关注.
- 在对儿童的大规模查中,唾液RT-PCR测试被证明是有效和成本效益高的,在某些情况下超过了NP快速抗原测试.
结论:
- 采用SYBR Green等DNA间隙染料的RT-PCR唾液测试为社区查SARS-CoV-2提供了一种强大,可靠和具有成本效益的战略.
- 这种方法为传统的NP抽样测试提供了一个不那么侵入性的替代方案,提高了大规模查的合规性和可行性.
- 该方法可适应检测其他传染病原体,使其成为未来流行病准备和应对的宝贵工具.


