在基于溶酸盐的无细胞系统中,对III型多基酸合成酶的表达策略进行分析
Tien T Sword1, Jaime Lorenzo N Dinglasan2,3, Ghaeath S K Abbas1,4
1Department of Chemistry, University of Tennessee-Knoxville, Knoxville, TN, USA.
Scientific reports
|June 5, 2024
概括
在无细胞系统中,编码协调和重构基因表达策略改善了自然产品的发现. 这种方法快速选各种细菌的功能性酶,促进自然产品研究的无细胞表达 (CFE).
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 合成生物学 合成生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 来自大肠杆菌中Actinobacteria等代谢多样化的细菌的基因表达,由于DNAGC含量和代码子使用的差异,因此存在挑战.
- 这些挑战导致蛋白质表达和折叠的不可预测问题,阻碍了新型天然产品的生物化学表征.
- 目前用于在可处理宿主中实现可溶性和活性蛋白质表达的方法往往耗时且涉及广泛的试错.
研究的目的:
- 研究生物合成基因集群 (BGC) 重构技术,使用III型多基酸合成酶RppA作为报告员.
- 评估细胞自由表达 (CFE) 系统在细胞实施前快速原型化表达参数的实用性.
- 探索促进子选择和子使用对蛋白质表达的协同效应.
主要方法:
- 创建了一个具有不同促销器和RppA编码序列的构造库,以研究促销器-codon使用协同作用.
- 细胞自由表达 (CFE) 系统被用于原型重构策略.
- 进行了体内实验,以比较CFE结果与细胞表达结果.
主要成果:
- 与传统的编码子优化相比,在无细胞和细胞系统中,编码子协调证明了自然产品合成的卓越改进.
- 编码序列和促进体之间的相互作用显著影响蛋白质表达,突出显示了在CFE中需要考虑协同作用的必要性.
- 在RppA和绿色光蛋白 (GFP) 之间,促进剂策略的有效性有所不同,这表明蛋白质特定的促进剂要求.
结论:
- 使用CFE重构促进体和/或编码序列是一种有效的策略,用于从BGC中快速选催化功能酶.
- 通过实现表达策略的高效原型设计,CFE成为加速自然产品研究的宝贵工具.
- 这些发现强调了考虑遗传元素和表达环境的协同作用对于优化蛋白质生产的重要性.


