针对EGFR外基子20插入的跨国熟练测试表明,测试设计很重要
Michaela A Ihle1, Carina Heydt2, Anne Maria Schultheis2
1Institute of Pathology, University of Cologne, Faculty of Medicine and University Hospital Cologne, Kerpener Str. 62, 50924, Cologne, Germany. michaela.ihle@uk-koeln.de.
Scientific reports
|June 6, 2024
概括
在非小细胞肺癌中精确检测表皮生长因子受体 (EGFR exon20ins) 突变对于向治疗至关重要. 下一代测序 (NGS) 证明在识别这些罕见突变方面优于PCR方法.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 遗传学 是一个遗传学.
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 皮表皮生长因子受体 (EGFR) 异构20插入突变 (EGFR exon20ins) 在非小细胞肺癌 (NSCLC) 中罕见.
- 这些突变赋予了对标准EGFR氨酸激酶抑制剂 (TKI) 的初级耐药性.
- 准确识别EGFR exon20ins对于患者获得新疗法如amivantamab和mobocertinib的资格至关重要.
研究的目的:
- 评估用于检测EGFR exon20ins的不同遗传检测方法的性能.
- 评估常规诊断测试在临床实践中识别这些特定突变的可靠性.
主要方法:
- 进行了两次国际能力测试,涉及104个研究所.
- 参与者分析了EGFR exon20ins.的组织和/或血样本.
- 评估的方法包括下一代测序 (NGS) 和突变/基因特异性定量PCR (qPCR).
主要成果:
- 下一代测序 (NGS) 在检测EGFR exon20ins.中表现出最高可靠性.
- 突变/基因特异性qPCR试验的成功率很低 (<30%的组织,0%的血).
- 许多qPCR测定没有设计用于检测EGFR exon20ins的全部光谱,从而导致虚假阴性.
结论:
- 在各种样本类型中,NGS是检测EGFR exon20ins的合适和优质方法.
- 目前商业上可用的突变/异位基因特异性qPCR测定在检测EGFR exon20ins的全部范围方面存在局限性.
- 使用NGS进行基于质量的常规基因检测对于识别NSCLC患者有资格接受向治疗至关重要.
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