一个长途迁徙蝙蝠Pipistrellus nathusii (Keyserling & Blasius,1839) 的简型解析参考基因组
Maximilian Driller1,2, Thomas Brown1,2, Shannon E Currie3,4
1Berlin Center for Genomics in Biodiversity Research (BeGenDiv), Berlin, Germany.
概括
我们为迁徙蝙蝠Pipistrellus nathusii生成了高质量的基因组. 这个资源有助于研究蝙蝠遗传学,进化和长途迁徙飞行的基因组基础.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 进化生物学 进化生物学
- 动物学 动物学
背景情况:
- 蝙蝠,特别是像Pipistrellus nathusii这样的迁徙物种,在基因组资源中代表性不足.
- 了解蝙蝠长途迁徙的遗传基础对于保护和进化研究至关重要.
研究的目的:
- 为了创建一个染色体尺度,阶段参考基因组Pipistrellus nathusii.
- 为研究蝙蝠进化,种群结构和迁徙适应提供基础的基因组资源.
主要方法:
- 使用长读数测序来实现高精度.
- 采用三维染色体构造捕获序列 (Hi-C) 进行分相和染色体组装.
- 进行了全面的蛋白质编码序列注释.
主要成果:
- 实现了对Pipistrellus nathusii的完整的染色体规模基因组组合.
- 自体单体和性染色体的两种类型都得到了解决.
- 该基因组有助于基因组重建在类动物的顺序内.
结论:
- 皮皮斯特雷勒斯 (Pipistrellus nathusii) 的参考基因组是蝙蝠基因组学的一个重大进展.
- 这种资源将使得对远距离迁徙和蝙蝠进化史的遗传基础进行详细的调查.


