一个类似CPF的酸酶模块将转录终止与染色体沉默联系起来
Eduardo Mateo-Bonmatí1, Miguel Montez2, Robert Maple2
1Cell and Developmental Biology, John Innes Centre, Norwich Research Park, Norwich NR4 7UH, UK; Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas, Universidad Politécnica de Madrid (UPM), Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA)/CSIC, Pozuelo de Alarcón, Madrid 28223, Spain.
这项研究揭示了RNA 3'处理因子 ANTHESIS PROMOTING FACTOR 1 (APRF1) 和 LUMINIDEPENDENS (LD) 如何通过在转录过程中改变染色质来调节花C (FLC) 的多沉默.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 基因调节 基因调节
- 染色体的动态 染色体的动态
背景情况:
- 协同转录调节,染色质环境和转录输出是相互关联的,但不太了解.
- 聚沉默是调节基因表达的关键表观遗传机制,特别是在植物中.
研究的目的:
- 为了阐明RNA 3'处理介导的Polycomb沉默在Arabidopsis中的FLOWERING LOCUS C (FLC) 基因的机制
- 确定特定蛋白质因子在这个过程中的作用.
主要方法:
- 研究了 ANTHESIS PROMOTING FACTOR 1 (APRF1) 与其他参与RNA处理和染色质修饰的蛋白质的相互作用.
- 利用遗传和生化方法研究APRF1,TYPE ONE SERINE/THREONINE PROTEIN PHOSPHATASE 4 (TOPP4) 和LUMINIDEPENDENS (LD) 的功能.
- 检查了LUMINIDEPENDENS (LD) 与FLOWERING LOCUS D (FLD) 的关联,这是一个基因组脱甲基酶.
主要成果:
- 证明了APRF1的要求,这是酵母Swd2和人类WDR82的同类物,用于RNA 3'处理介导的FLC的Polycomb沉默.
- 确定了APRF1,TOPP4和LD之间的相互作用,突出了它们在CPF 3'终端加工机械的酸酶模块中的作用.
- 表明LD与FLD,一种组分素H3K4脱甲基酶共同关联,将RNA处理与染色质修饰联系起来.
结论:
- 由APRF1/LD介导的多化和终结过程通过改变FLC的局部染色体环境来影响后续的转录轮.
- 这项研究为RNA处理,Polycomb静音和植物染色体调节之间的交叉声提供了新的见解.
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