基于规则的奥米克斯挖矿揭示了抗微生物宏环对抗耐药临床分离物的抗菌性
Zhuo Cheng1,2, Bei-Bei He1, Kangfan Lei3
1Department of Chemistry and The Swire Institute of Marine Science, The University of Hong Kong, Pokfulam Road, Hong Kong, China.
Nature communications
|June 8, 2024
概括
我们使用omics挖矿和表达发现了含有aminovinyl-(methyl) cysteine (Avi(Me) Cys的新型抗生素. 马萨提德A对抗性细菌表现出强烈的活性,提供了一个有前途的新抗生素候选者.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 生物化学 生物化学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 抗菌素耐药性是一个关键的全球卫生问题,需要新的治疗药物.
- 核糖体合成和翻译后修饰 (RiPPs) 为新型抗生素发现提供了多样化的化学支架.
研究的目的:
- 识别和描述来自Avi(Me) Cys类的新型抗生素.
- 评估新发现的对多抗药性病原体的疗效.
主要方法:
- 生物信息挖掘超过5万个细菌基因组,以识别RiPP生物合成基因集群 (BGCs).
- 生物合成规则引导的代谢分析,将BGC与生物合成联系起来.
- 新型抗生素的特征表达的异质表达式.
主要成果:
- 确定了1172个与含有Avi(Me) Cys相关的BGCs.
- 将三种BGC与五种抗生素的生物合成联系起来.
- 发现了massatide A,一种具有强大活性 (MIC 0.25μg/mL) 的V类兰氏,对抗格兰阳性病原体,包括耐药菌株如MRSA和耐线胺的黄金色杆菌.
结论:
- 由于其有效性,良好的安全性和耐药性风险较低,Massatide A作为抗生素候选药物具有显著的潜力.
- 含有Avi(Me) Cys是开发针对多药耐药细菌感染的新疗法的宝贵资源.


