预测临床意义上的前列腺癌通过特定的原相关的转录基因,蛋白质基因和尿基因的签名
Isabel Heidegger1, Maria Frantzi2, Stefan Salcher3
1Department of Urology, Medical University of Innsbruck, Innsbruck, Austria.
European urology oncology
|June 9, 2024
概括
前列腺癌 (PCa) 组织和尿液中的原体特征准确地检测出临床显著的PCa (csPCa). 这些发现,特别是来自尿液分析的发现,有望改善PCa诊断并减少不必要的活检.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 生物化学 生物化学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 原蛋白密度与各种癌症的不良结果有关,但其在前列腺癌 (PCa) 中的作用尚不清楚.
- 临床意义上的PCa (csPCa) 检测依赖于准确的诊断标记.
研究的目的:
- 调查转录组,蛋白组和尿组中与原蛋白相关的变化,以检测csPCa.
- 为了评估原体签名的诊断性能与已建立的标记物,如前列腺特异性抗原 (PSA) 和多参数磁共振成像 (mpMRI) 相比.
主要方法:
- 对PCa转录组 (n=1393),蛋白组 (n=104) 和尿组 (n=923) 数据的分析,重点关注55个原相关基因.
- 利用单细胞RNA测序来识别原体转录的细胞来源.
- 使用统计评估,集群和机器学习模型来识别csPCa签名.
主要成果:
- 在csPCa中观察到30个原基因和34种蛋白质的差异表达,与良性或低级组织相比.
- 一个高原的癌症集群显示出明显的细胞和分子特征,包括纤维细胞透和增强的信号通路.
- 基于原的机器学习模型的表现优于PSA和年龄,在预测csPCa方面表现相当于mpMRI.
- 一个基于尿液的原模型在5个疑似PI-RADS 3病变的5个病例中4个中确定了csPCa.
结论:
- 组织和尿液中的与原蛋白相关的特征可以准确预测csPCa.
- 这些签名为PSA和csPCa检测提供了更高的精度和年龄.
- 原签名,特别是来自尿液的原签名,显示出作为液体活检工具的潜力,以减少不必要的活检,并提高PCa风险分层的诊断精度.
