权重基因共同表达网络分析和全基因组测序确定了潜在的肺癌生物标志物

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 遗传学 是一个遗传学.
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 结核病 (TB) 与肺癌 (LC) 的风险增加有关.
• 驱动结核病相关的LC的精确分子机制在很大程度上是未知的.
• 了解这些机制对于开发有针对性的疗法至关重要.

研究的目的:

• 为了确定关键的基因和分子途径,涉及肺癌与结核病相关的病变发生.
• 使用综合基因组方法阐明结核病相关的LC的遗传基础.
• 发现结核病相关的LC的新型治疗点.

主要方法:

• 对公开可用的数据集 (GSE43458,GSE83456,GSE42834) 进行了基因共同表达网络分析 (WGCNA).
• 全外体序列测序 (WES) 在15名患者中进行,分为结核病,慢性结核病和结核病+慢性结核病组分层.
• 对差异表达基因,枢纽基因和体质突变的鉴定随后进行了途径分析 (KEGG).

主要成果:

• 共有278个与肺结核瘤发生相关的枢纽基因被确定.
• 在患者队列中,WES在25个基因中发现了112个体质突变.
• 通过综合分析确定了四种常见基因 (EGFR,HSPA2,CECR2,LAMA3),所有这些基因都与PI3K-AKT信号通路有关.

结论:

• EGFR,HSPA2,CECR2和LAMA3被确定为结核病相关的LC中的潜在关键基因.
• PI3K-AKT信号通路被突出显示为与结核病同时发生的LC发展中的显著丰富的通路.
• 这些发现为未来对结核病相关的LC分子机制和治疗策略的研究提供了基础.