微生物代谢物预测多原子分析工具
Shengbo Wu1,2, Haonan Zhou1, Danlei Chen1,2
1School of Chemical Engineering and Technology, Tianjin University, Tianjin 300072, China.
Briefings in bioinformatics
|June 11, 2024
概括
解锁微生物代谢暗物质需要多种omics. 将基因组学,转录组学,蛋白质组学和代谢组学结合起来,有助于预测微生物代谢物的健康和疾病洞察力.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 微生物代谢暗物质在识别生物活性分子方面提出了重大挑战.
- 多种omics技术已经推进了对个体菌株的微生物代谢物的预测.
研究的目的:
- 系统地审查和分类过去五年开发的微生物代谢物预测工具.
- 突出多原子集成对于全面了解微生物新陈代谢的重要性.
主要方法:
- 对更新的预测数据库,网络服务器和基于基因组学,转录组学,蛋白质组学和代谢组学的软件进行调查.
- 讨论将多学科数据与系统生物学和数据驱动算法集成.
主要成果:
- 识别各种基于omics的工具,用于微生物代谢物预测.
- 强调结合不同omics数据集的协同效益.
结论:
- 多原子方法对于克服单原子研究的局限性至关重要.
- 未来的趋势集中在开发先进的多原子工具,以全面预测与人类健康和疾病相关的微生物代谢物.
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