为预测HNSCC远程转移而构建名图,并将EIF5A识别为枢纽基因
Xin Chen1, Ying Zhang2, Sheng Chen3
1Department of Oral and Maxillofacial Surgery, Nanjing Stomatological Hospital, Affiliated Hospital of Medical School, Institute of Stomatology, Nanjing University, Nanjing, China.
Scientific reports
|June 11, 2024
概括
这项研究确定了EIF5A作为关键基因,与头部和部状细胞癌 (HNSCC) 的远程转移有关. 这些发现支持EIF5A和miR-424作为早期诊断HNSCC转移的潜在生物标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 头角状细胞癌 (HNSCC) 的远程转移显著恶化了患者的预后.
- 早期检测HNSCC转移仍然是一个临床挑战,往往通过成像迟诊断.
研究的目的:
- 确定分子标记物用于早期诊断HNSCC的远程转移.
- 开发HNSCC远程转移的预测模型.
- 阐明HNSCC远程转移背后的分子机制.
主要方法:
- 对转移性与非转移性HNSCC中差异表达基因 (DEGs) 和lncRNAs的TCGA和GEO数据库的分析.
- 构建一个23-lncRNA预测模型和一个用于转移预测的名图.
- 权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 和Cytoscape用于识别关键基因.
- 通过GEO数据和免疫组织化学验证EIF5A表达式.
- 使用TargetScan和miRWalk对miRNA与EIF5A相互作用的预测和验证.
主要成果:
- 基于23个lncRNAs的预测模型被开发用于HNSCC远程转移.
- EIF5A被确定为一个关键的基因,在远程转移的HNSCC中显著上调.
- 确定miR-424是与EIF5A相互作用的关键miRNA.
- 在初级瘤中,高EIF5A表达与远程转移相关.
结论:
- EIF5A及其与miR-424的相互作用为早期检测HNSCC转移提供了一个新的视角.
- 开发的诺米克图和已识别的生物标志物可以帮助预测HNSCC患者的远程转移.
- 这项研究提供了对驱动HNSCC远程转移的分子机制的见解.
