评估使用药物特性对假定抗胆固醇药物的抗胆固醇性认知负担分类
Geofrey Oteng Phutietsile1, Nikoletta Fotaki1,2, Prasad S Nishtala1,2
1Department of Life Sciences, University of Bath, Bath, UK.
机器学习有效地使用药物ADME和物理化学数据创建了一个新的抗胆固醇负担量表. 这种新型尺度显示了比现有的抗胆性认知负担 (ACB) 和抗胆性毒性评分 (ATS) 尺度更好的表现.
科学领域:
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
- 计算化学计算化学
- 机器学习 机器学习
背景情况:
- 抗胆固醇药物负担尺度对于评估药物安全性至关重要,特别是在脆弱人群中.
- 像ACB和ATS这样的现有尺度在准确分类药物抗胆固醇作用方面存在局限性.
- 准确的分类需要考虑除了简单的结合亲和力之外的多种药物特性.
研究的目的:
- 使用机器学习开发一种新的抗胆固醇负担量表.
- 整合药物吸收,分布,新陈代谢和分泌 (ADME) 数据与物理化学和药理学特性.
- 将新型尺度的性能与已建立的尺度 (ACB和ATS) 进行比较.
主要方法:
- 收集了实验和in silico ADME,物理化学和药理学数据.
- 利用了五种关键药物特性:抗肌糖活性,穿透血脑屏障,生物可用性,化学结构和P-糖蛋白 (P-gp) 基质形状.
- 训练了一种无监督的机器学习模型来分配抗胆固醇负担得分,并使用10倍交叉验证进行评估.
主要成果:
- 新型无监督模型实现了0.76的曲线下的平均面积 (AUC),超过了ACB尺度 (0.64).
- 无监督模型与ACB尺度 (49/88药物) 与ATS尺度 (12/25药物) 相比,显示出更好的一致性.
- 在 silico 工具准确地识别了具有有限血脑屏障透率的药物.
结论:
- 由于忽视了血脑屏障 (BBB) 透,ACB尺度可能会错误地分类药物.
- 由于ATS尺度仅依赖肌酸结合亲和力,因此可能导致错误分类.
- 机器学习模型为抗胆固醇负担评估提供了一种更具普遍性和易于更新的方法.
更多相关视频
11:44Cellular Membrane Affinity Chromatography Columns to Identify Specialized Plant Metabolites Interacting with Immobilized Tropomyosin Kinase Receptor B
Published on: January 19, 2022
12:18A Machine Learning Approach to Design an Efficient Selective Screening of Mild Cognitive Impairment
Published on: January 11, 2020
相关概念视频
Cognitive Enhancers: Cholinesterase Inhibitors and NMDA Receptor Antagonists
Indirect-Acting Cholinergic Agonists: Pharmacological Actions
At the neuromuscular junction, these agents work by inhibiting the breakdown of acetylcholine, allowing it to remain bound to the receptor and bind to nearby receptors. This process leads to repetitive firing of the endplate, causing muscle...
Cholinergic Antagonists: Pharmacological Actions
Gastrointestinal Effects: Antimuscarinics reduce gut contractions, increase gastric emptying, and slow intestinal transit. They partly inhibit gastric acid secretion...
Cholinergic Antagonists: Therapeutic Uses
Respiratory Tract: Ipratropium, aclidinium, and tiotropium treat asthma, chronic bronchitis, and chronic obstructive pulmonary disease (COPD). They protect against bronchoconstriction caused by irritants like cigarette smoke, sulfur dioxide, and ozone. They also help reduce nasopharyngeal...
Cholinergic Antagonists: Pharmacokinetics
Drug Classes and Categories
