鼻腔微生物群是重症监护病房中败血症的潜在诊断生物标志物
XiLan Tan1,2, Haiyue Liu3, Wen Qiu4
1Division of Infection Medicine, Zhujiang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, China.
Microbiology spectrum
|June 12, 2024
概括
鼻腔微生物群的组成在败血症患者中显著不同,提供比肠道微生物群更有效的诊断生物标志物. 这一发现有助于开发新的败血症诊断策略.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 医学诊断 医学诊断 医学诊断
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 败血症的诊断依赖于临床症状,往往导致治疗延迟.
- 微生物群分析为早期毒症检测提供了潜力.
- 在败血症中比较肠道和鼻腔微生物群对于确定可靠的生物标志物至关重要.
研究的目的:
- 在败血症患者中描述肠道和鼻腔微生物群.
- 为了确定用于败血症诊断的微生物生物标志物.
- 评估鼻腔与肠道微生物群的诊断潜力.
主要方法:
- 从157名败血症和非败血症患者收集了鼻腔和便样本.
- 使用Illumina技术测序了16S rRNA基因V4区域.
- 应用生物信息学,统计分析和用于区分的机器学习.
主要成果:
- 败血症患者显示鼻腔微生物丰富度降低和组成变化.
- 在败血症中丰富的鼻腔属包括Corynebacterium,Staphylococcus,Acinetobacter和Pseudomonas.
- 使用鼻腔微生物群的机器学习模型在败血症分化方面实现了89.08%的AUC,超过了肠道微生物群 (49.24%AUC).
结论:
- 鼻腔微生物群的组成是一个比肠道微生物群更有效的败血症诊断生物标志物.
- 基于鼻腔微生物群的机器学习模型显示出高诊断准确度.
- 这些发现支持开发鼻腔微生态毒症诊断工具.
