通过应用SoFDA,对疾病-综合征-公式关联的本体学特征,丰富分析和基于相似性计算的评估

科学领域:

• 综合医学和生物信息学
• 计算生物学和药理学 计算生物学和药理学

背景情况:

• 传统中医 (TCM) 综合征缺乏用于个性化医学的标准化分子数据.
• 现有的TCM理论需要与现代生物医学信息进行整合,以加强药物发现和临床应用.

研究的目的:

• 开发第一个集成的网络平台SoFDA,用于分析TCM综合征,疾病和草药配方之间的关系.
• 为探索TCM综合征的分子基础提供一个工具,并促进量身定制的治疗干预.

主要方法:

• 构建了SoFDA的319个TCM综合征,8045种疾病和1359种TCM草药配方的精选本体学.
• 在TCM综合征和生物医学实体之间使用Jaccard/Cosine相似性实现了关联测量.
• 验证了与病例和对照数据的关联,探索异构的生物医学网络中的多途径关系.

主要成果:

• SoFDA能够对有前途的关联进行排名和过,用于疾病诊断和量身定制的干预措施.
• 该平台通过将基因和症状集与TCM综合征,公式和疾病联系起来,促进功能说明.
• 在疾病,TCM综合征,基因,公式,药物点和途径之间展示了多途径的关联.

结论:

• SoFDA提供了有关疾病特异性TCM综合征的生物学基础和分子机制的见解.
• 该平台支持针对TCM综合征中的单个或多个症状的量身定制治疗.
• 为现代生物医学和制药应用更深入地了解TCM提供便利.