单细胞RNA测序功能识别的神经元群体的样本采集协议 in vivo

科学领域:

• 神经科学是一个神经科学.
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 研究神经元群体需要方法来隔离特定的,活跃的细胞.
• 活动依赖标签工具对于研究动态神经过程至关重要.

研究的目的:

• 介绍一个详细的协议单细胞RNA测序的功能识别的神经元群体 in vivo.
• 为了使在特定的行为事件中激活的神经元中的基因表达的研究.

主要方法:

• 使用CAMPARI2,一种病毒传递的依赖活动的标签工具.
• 采用虚拟现实环境来触发用于照片转换的计算相关事件.
• 组织加工,包括解离和光激活细胞分类 (FACS),用于分离标记的细胞.
• 标准生物信息技术用于表征功能相关的神经元组.

主要成果:

• 成功隔离和收集基于活动的照片标记的神经元群体.
• 一个工作流程的演示,整合了体内标签,细胞分类和下游测序.
• 建立一种方法来检查行为激活神经元的基因表达特征.

结论:

• 本协议提供了一种可靠的方法,用于单细胞RNA测序特定的,活跃的神经元群体.
• 这种技术有助于理解神经电路功能和行为过程中的基因表达动态.
• 该协议对于研究神经活动及其分子基础的研究人员来说是有价值的.