高性能TadA-8e衍生的细胞因子和双基编辑器,在植物中具有无法检测的目标外效应
Tingting Fan1,2, Yanhao Cheng3, Yuechao Wu4,5
1Department of Biotechnology, School of Life Sciences and Technology, Center for Informational Biology, University of Electronic Science and Technology of China, Chengdu, 610054, China.
Nature communications
|June 14, 2024
概括
来自TadA-8e的新型细胞因子基编辑器 (CBEs) 在植物中显示出高效率和特异性. 双重编辑器可以同时进行C-to-T和A-to-G编辑,从而推进作物工程应用.
科学领域:
- 植物生物技术 植物生物技术
- 分子生物学分子生物学
- 基因组编辑 基因组编辑
背景情况:
- 细胞因子基编辑器 (CBE) 和腺因基编辑器 (ABE) 对于精确的DNA修改至关重要.
- 从TadA-8e衍生出的ABE8e已经改善了植物中的A-to-G编辑.
- TadA-8e可以被设计为C-to-T编辑,扩大其实用性.
研究的目的:
- 为了比较米和西红中的TadA-8e衍生的工程CBEs.
- 开发和评估一个可同时进行C-to-T和A-to-G编辑的双基编辑器.
- 为了展示多重基编辑和作物工程应用.
主要方法:
- 在TadA-8e衍生CBE (TadCBEa,TadCBEd,TadCBEd_V106W) 的工程和特征.
- 开发一个双基编辑器 (TadDE),用于同时编辑.
- 在转基因大米中应用多重基编辑.
- 全基因组和转录组测序用于非目标分析.
- 农作物工程应用:除草剂耐药性和miRNA目标修改.
主要成果:
- 在大米和番茄中确定了高纯度和狭窄的编辑窗口的高效CBE (TadCBEa,TadCBEd,TadCBEd_V106W).
- 使用双基编辑器TadDE,演示了同时进行C-to-T和A-to-G编辑.
- 在转基因大米中展示了具有高特异性的多重基因编辑,并且没有可检测的目标外效应.
- 通过使用TadDE.成功引入了抗除草剂的耐药性和通过同义突变修改基因表达.
结论:
- 来自TadA-8e的CBEs是植物基因组编辑的有效工具.
- 双基编辑器TadDE提供了同时C-to-T和A-to-G编辑功能.
- 这些进步为改善作物和基因工程提供了有价值的新工具.
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