UPLC-Q-TOF-MS/MS结合机器学习方法用于选Hypericum perforatum L的质量指标
Zhiyong Zhang1, Zehua Ying1, Mulan He1
1College of Pharmaceutical Engineering of Traditional Chinese Medicine, Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, Tianjin 301617, PR China.
Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
|June 15, 2024
概括
这项研究确定了Hypericum perforatum L. (圣约翰草) 中的五个关键化合物作为使用代谢学和机器学习的质量控制标记. 这些标记物确保药用植物质量的一致性.
科学领域:
- 植物化学 植物化学
- 化学信息学 化学信息学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
背景情况:
- 胡桃 (Hypericum perforatum L.) 是一个广泛研究的药用植物,具有显著的治疗潜力.
- 建立强有力的质量控制措施对于确保像HPL这样的草药的有效性和安全性至关重要.
- 传统的质量控制方法可能无法完全捕捉药用植物的复杂化学特征.
研究的目的:
- 确定可靠的质量指标,以进行Hypericum perforatum L. (HPL) 的整体质量控制.
- 利用非目标代谢学和机器学习来发现潜在的质量标记.
- 为了有效的质量评估,使用机器学习分类器验证选择的标记.
主要方法:
- 使用高分辨率质谱 (MS) 分析HPL样本并通过MS分子网络可视化化学化合物.
- 坐标部分最小平方差异分析 (OPLS-DA) 用于识别植物部分之间的差异代谢物.
- 进行了蛋白质与蛋白质相互作用 (PPI) 网络分析,以评估已识别的代谢物的药理学活性,随后进行机器学习验证 (SVM,RF,KNN).
主要成果:
- 在HPL中总共发现了122种化合物,在花,叶和树枝样本中选了46种差异代谢物.
- 药理学分析揭示了与473个基因标相关的25种化合物,从而选择了13种潜在的质量标记物.
- 最终选择了五种化合物作为质量控制标记,随机森林模型在验证中显示出最佳性能.
结论:
- 该研究成功地确定了五种关键化合物,作为Hypericum perforatum L.的有效质量控制标记物.
- 代谢学和机器学习的综合方法为HPL的整体质量控制提供了一个强大的战略.
- 这种方法可以作为其他药用草药产品质量控制的宝贵参考.
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