完成了多抗药性医院病原体Staphylococcus epidermidis ST21515的基因组和出现场景
Therese Kellgren1, Chinmay Dwibedi2, Micael Widerström3
1Department of Mathematics and Mathematical Statistics, Umeå University, Umeå, SE, 90187, Sweden.
BMC microbiology
|June 18, 2024
概括
多种药物耐药的 Staphylococcus epidermidis ST215 导致感染. 全基因组测序揭示了ST215和ST2血统通过重组进化,获得抗生素耐药性和毒性基因.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- ST215是一种多药耐药的Staphylococcus epidermidis血统,在北欧普遍存在,导致假肢关节和深部手术部位感染.
- 增加S. epidermidis的抗生素耐药性是一个全球性的健康问题.
- 本研究的重点是从医疗保健环境中描述ST215.
研究的目的:
- 执行ST215血统的全基因组测序和家族遗传分析.
- 调查基因组复合在ST215和ST2谱系进化中的作用.
- 为了将抗微生物耐药性和毒性基因含量与基因组数据相关联.
主要方法:
- ST215分离物的全基因组测序 (短读和长读).
- 使用1361个公开的S. epidermidis参考基因组进行了家族遗传学分析.
- ST215和ST2谱系的比较基因组学,包括对重组事件和抗菌素耐药性基因的分析.
主要成果:
- ST215基因组由一个染色体和一个等离子体组成;遗传学分析将其置于更广泛的S. epidermidis背景中.
- ST215和ST2两种谱系都显示出显著的基因组重组证据 (30-50 kb事件).
- 观察到抗菌素耐药性特征的高度相似性,ST215和ST2.2之间共有22个耐药性基因. 病毒性基因在ST215重组事件中过度表现,而抗生素耐药性基因在ST2.2中过度表现.
结论:
- ST215基因组表现出广泛的抗生素耐药性和毒性基因含量.
- 基因组重组是推动ST215和ST2血统进化的关键机制,促进了耐药性和毒性.
- 像ST215这样的多抗药性S. epidermidis血统的出现在医疗保健环境中构成重大威胁.
