在患有不同SARS-CoV-2变种的患者中识别各种复合物

科学领域:

• 病毒学 病毒学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 病毒重组,即共感染病毒之间的遗传物质交换,可以导致新型病毒株的出现,其病毒性发生变化.
• 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 变种如Delta和Omicron已经在全球传播,为共感染和再组合提供了机会.

研究的目的:

• 为了研究与SARS-CoV-2 Delta和Omicron变种共感染的患者病毒重组的潜力.
• 为了描述在尖基因中发现的重组SARS-CoV-2的遗传构成.

主要方法:

• 使用分子试验和全基因组测序分析了来自五名COVID-19患者的样本.
• 长读和桑格测序来自共感染患者的全长尖峰基因,以识别病毒类类型.
• 检测和表征SARS-CoV-2变种 (三角形和奥米克朗) 和它们的复合物.

主要成果:

• 一名患者表现出SARS-CoV-2Delta和Omicron变种的混合感染.
• 病毒类比分析揭示了尖端基因内的九个不同的重组序列,在Delta和Omicron之间有不同的断点.
• 这些重组序列显示出与在美国和欧洲的Delta和Omicron共同流通期间检测到的病毒具有很高的遗传相同性.

结论:

• 与不同SARS-CoV-2变种的联合感染可能导致各种病毒复合物的产生.
• 多种SARS-CoV-2变异的共同循环可能会促进各种重组病毒的产生.