概念验证研究:自我和医生收集的HPV阳性和HPV阴性宫阴道样本中微生物群多样性的可比性

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 妇科 妇科医生 妇科
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 人类乳头瘤病毒 (HPV) 感染显著改变宫性阴道微生物群.
• 关于使用自收集标本 (SCS) 来检测微生物组的研究有限,尽管HPV检测方法标准化.
• 了解宫-阴道微生物组合对于生殖健康和宫癌查至关重要.

研究的目的:

• 评估SCS在检测宫性阴道微生物组合物的有用性.
• 将SCS中的微生物组数据与医生收集的液体细胞学 (LBC) 样本进行比较.
• 使用这两种采集方法,评估HPV状态和宫性阴道微生物组资料之间的相关性.

主要方法:

• 在配对的SCS (Evalyn Brush) 和LBC样本上利用了16SrRNA基因的牛津纳米孔测序.
• 分析了α-多样性和β-多样性指标,以比较采集方法之间的微生物组组成.
• 根据已识别的细菌属和物种,分类样本为社区状态类型 (CST),包括*Lactobacillus*.

主要成果:

• 在SCS和LBC样本之间没有观察到α-多样性或β-多样性的显著差异.
• 来自同一个体的配对样本聚集在一起,表明通过这两种方法检测到一致的微生物群.
• 与HPV阳性样本相比,HPV阳性样本显示出更高的细菌多样性,更低的乳酸菌丰度,以及像Sneathia和Dialister这样的属性增加.
• 配对样本始终属于相同的CST,而HPV状态与不同的CST相关.

结论:

• 自我采集的标本 (SCS) 是分析宫和阴道微生物组合的可行选择.
• 使用SCS进行微生物组分析,其结果与传统的LBC方法相美.
• 与HPV检测相结合的自我采样为全面的宫癌查和微生物组评估提供了有希望的方法.