虫的胺酶组:对不同发育阶段的转录组分析
Nikita I Zhiganov1, Konstantin S Vinokurov2, Ruslan S Salimgareev3
1A.N. Belozersky Institute of Physico-Chemical Biology, Lomonosov Moscow State University, Moscow 119991, Russia.
International journal of molecular sciences
|June 19, 2024
概括
研究人员在黄色粉虫Tenebrio molitor中鉴定出269种血清酶 (SPs) 和同类物 (SPHs). 许多在养阶段表达的SPs/SPHs对消化至关重要,而另一些则调节生理过程.
科学领域:
- 生物化学和分子生物学
- 昆虫基因组学和蛋白质组学
背景情况:
- 甲基素S1A亚家族的血清酶 (SPs) 是所有动物生物体中存在的重要酶,包括昆虫.
- 了解黄色粉虫 (Tenebrio molitor) 等昆虫中SPs的多样性和功能对于理解它们的生物作用至关重要.
研究的目的:
- 为了全面分析Tenebrio molitor转录组和基因组中的酸盐酶 (SPs) 和酸盐酶同类物 (SPHs).
- 描述这些已识别的SPs和SPHs在Tenebrio molitor不同发育阶段的表达模式.
- 阐明SP和SPH在各种生理过程中的潜在作用,特别是消化和发育.
主要方法:
- 对Tenebrio molitor转录组和基因组数据集的生物信息分析,以识别SP和SPH.
- 基于保存的催化三残留物和域组织的识别序列的分类.
- 使用现有的数据集,分析不同生命阶段 (卵,幼虫,,成年人) 的基因表达模式.
主要成果:
- 总共有269个SPs被确定,其中137个具有保存的催化三残留物,125个被提出为非活性血清酶同类物 (SPHs).
- 七个序列表现出复杂的域组织,具有多个酶单元,预测为活性或非活性.
- 缺乏调节域的SP和SPH主要表达在食阶段 (幼虫,成年人),这表明它们在消化过程中起作用.
- 具有调节域的SP和SPH在卵和/或蛋中表现出构成性或上调的表达,表明它们在生理调节中的作用.
- 大多数多酶主要表达在幼和成年阶段.
结论:
- 这项研究提供了Tenebrio molitor中胺酶和同类的综合目录,扩大了对昆虫中这种酶家族的知识.
- 表达模式表明不同的SP/SPH群体具有不同的作用,在幼虫/成年人中具有消化功能,在早期/晚期发育阶段具有调节作用.
- 这些发现为未来对S1A亚家族蛋白在Tenebrio molitor和其他昆虫物种中的功能性研究奠定了基础.
