快速确定SARS-CoV-2的完整性和传染性,通过使用Propidium Monoazide与数字滴滴PCR相结合
Giuseppe Sberna1, Cosmina Mija1, Eleonora Lalle1
1Laboratory of Virology and Biosafety Laboratories, National Institute for Infectious Diseases "Lazzaro Spallanzani" (IRCCS), 00149 Rome, Italy.
International journal of molecular sciences
|June 19, 2024
概括
这项研究引入了一种使用 propidium monoazide (PMAxx) 和数字滴滴PCR (ddPCR) 的新方法,以在患者样本中区分传染性SARS-CoV-2和非传染性病毒物质. 该技术有助于确定COVID-19患者是否需要持续的预防和治疗措施.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 分子诊断学 分子诊断
背景情况:
- 由于SARS-CoV-2导致COVID-19大流行,因此需要对传染性进行准确的评估,特别是在持续阳性患者中.
- 区分传染性和非传染性SARS-CoV-2对于指导公共卫生干预和患者管理至关重要.
- 目前的方法可能无法有效地区分临床样本中的可活和不可活的病毒颗粒.
研究的目的:
- 开发和验证一种快速的方法,以在鼻口腔抽样中区分传染性和非传染性SARS-CoV-2.
- 为此目的,评估一氧化 (PMAxx) 与数字滴滴PCR (ddPCR) 结合的实用性.
- 为了将ddPCR结果与病毒隔离和负链PCR相关联,以确定病毒活力.
主要方法:
- 一种新的方法,结合了先前处理与甲 (PMAxx) 和数字滴滴PCR (ddPCR) 的方法,被应用于40个鼻支片 (NPSs).
- 在PMAxx治疗前和后分析样本,以量化SARS-CoV-2病毒载量.
- 六个样本通过Ct值进一步分层,并与体外病毒隔离和负链PCR进行比较.
主要成果:
- PMAxx-ddPCR治疗使平均病毒载量减少了0.9日志副本/毫升.
- 两个治疗后SARS-CoV-2负载最高的样本在体外隔离时产生了传染性病毒,并显示了负链RNA的阳性结果.
- 三个治疗后病毒负载较低的样本没有产生传染性病毒,并且显示了负链RNA的负结果.
结论:
- 开发的PMAxx-ddPCR方法有效地区分了感染性和非传染性SARS-CoV-2在鼻擦拭样本中的不同.
- 这项技术为评估持久SARS-CoV-2阳性患者的感染状况提供了有价值的工具.
- 这些发现支持使用这种方法来指导有关感染控制和治疗策略的决策.
