在葡萄藤中转录因子WRKY的全基因组识别,特征和演变 (Vitis vinifera):新的观点和更新

科学领域:

• 植物分子生物学 植物分子生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 进化生物学是进化的生物学.

背景情况:

• WRKY转录因子调节植物发育和应激反应.
• 葡萄树中WRKY基因的进化和特定作用尚不清楚.
• 在葡萄藤中不一致的WRKY基因命名导致了混乱.

研究的目的:

• 为了识别和系统地编号所有WRKY基因在Vitis vinifera.
• 分析 WRKY 基因结构,氨基酸变异性和家族遗传关系.
• 为了研究葡萄藤中WRKY基因的进化历史.

主要方法:

• 在六种品种中对62种Vitis vinifera WRKY基因进行全基因组识别.
• 基于染色体位置的标准化编号.
• 对基因结构,氨基酸序列和家族遗传学类的分析.
• 识别仿真WRKY基因及其域.

主要成果:

• 一个完整的 62 个葡萄酒 WRKY 基因与修订编号的目录.
• 在一些 WRKY 中观察到跨品种的显著氨基酸变异 (>5%).
• 发现了具有独特域的仿真WRKY基因 (例如VvWRKY17,VvWRKY61).
• 遗传学分析揭示了与WRKY群体 (I-III) 相对应的五个类 (A-E).

结论:

• 这项研究为葡萄藤WRKY基因提供了一个统一的命名体系.
• 对WRKY基因结构,变异性和维蒂斯葡萄酒的进化进行了新的洞察.
• 一个为WRKY基因提出的进化模型,具有复杂性和简化的动态阶段.