一个基于碎片的竞争F LB-NMR平台用于热点导向的干剖析
William J McCarthy1,2, Sherine E Thomas3,4, Tayo Olaleye1
1Yusuf Hamied Department of Chemistry, University of Cambridge, Lensfield Road, Cambridge, UK, CB2 1EW.
Angewandte Chemie (International ed. in English)
|June 19, 2024
概括
我们开发了一个新的查平台,使用具有竞争力的19F基核磁共振 (LB-NMR) 来精确量化蛋白热点的基结合. 这种方法通过在高分辨率下绘制配体相互作用,使有效的热点导向药物发现成为可能.
科学领域:
- 生物化学 生化学
- 结构生物学 结构生物学
- 化学生物学 化学生物学
背景情况:
- 带结合热点对于有效的药物设计至关重要.
- 目前的方法往往缺乏用于热点指导的连接体分析的定量分析.
- 准热点可以最大限度地提高连接体结合效率.
研究的目的:
- 引入基于碎片的竞争性19F基基核磁共振 (LB-NMR) 查平台.
- 为了实现常规化,定量性连接体分析专注于连接体结合热点.
- 为了证明平台对热点导向的连接体发现的实用性.
主要方法:
- 对960种化合物进行基于碎片的查,以对抗Mycobacterium abscessus PPAT.
- 用X射线晶体学来识别联结热点.
- 为每个热点设计和合成19F记者分子.
- 竞争性19F LB-NMR测定用于连接体结合概况.
主要成果:
- 在Mabs PPAT活性部位上确定了三个不同的联结热点.
- 为每个已识别的热点开发了特定的19F记者.
- 竞争性19F LB-NMR准确地回顾了绑定亲和关系和地点分配.
- 结果与ITC和X射线晶体学等传统方法相对相关.
结论:
- 基于碎片的竞争性19F LB-NMR平台提供了对联体形的定量,热点级别的分辨率.
- 这个平台对于有效的药物发现有价值,因为它专注于关键的相互作用点.
- 该方法建立了一个强大的方法来优化在已识别的热点上的联结结合.
