在中国开启SCID新生儿查,通过全外体序列测序检测新的外体基因变异
Xiao Yang1, JianHu He2, Wei Peng1
1Faculty of Pediatrics, the Chinese PLA General Hospital, Beijing, China; Institute of Pediatrics, the Seventh Medical Center of PLA General Hospital, Beijing, China; National Engineering Laboratory for Birth defects prevention and Control of key technology, Beijing, China; Beijing Key Laboratory of Pediatric Organ Failure, Beijing, China.
严重联合免疫缺陷 (SCID) 在新生儿中具有很高的检测率. 整体外体测序发现了MUC6等关键基因突变,这对于开发新的SCID诊断方法至关重要.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组医学是基因组医学.
背景情况:
- 严重联合免疫缺陷 (SCID) 是一种致命的遗传性疾病.
- 遗传突变是大多数儿童SCID病例的基础.
研究的目的:
- 通过使用全外体序列测序 (WES) 调查SCID的遗传格局.
- 识别与SCID相关的新型遗传变异和分子特征.
- 评估将SCID纳入新生儿查计划中的可能性.
主要方法:
- 在17名SCID患者身上进行了WES.
- 分析了来自GEO数据集 (GSE609,GSE99176) 的基因表达数据.
- 进行了基因组变异分析 (GSVA) 和相关性分析.
主要成果:
- 在新生儿重症监护室 (NICU) 队列中观察到6.8%的SCID检测率.
- 在17个SCID样本中确定了16个基因,MUC6和RP11-683L23.1显示出高突变频率 (94%).
- CNN2和SCGB1C1表现出显著的共同突变;与家族遗传分类相关的MUC6突变. 与免疫相关的途径得到了丰富,Foxd4显示了反向相关性.
结论:
- 由于SCID的发病率和致死率很高,因此需要将其纳入中国的新生儿查 (NBS).
- WES有效地发现了像MUC6这样的常见异构变异,有助于开发新的SCID诊断策略.
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