在2012年至2021年期间,瑞典爆发的EHV-1不同菌株在瑞典爆发
Johan Öhrmalm1, Harindranath Cholleti2, Anna-Karin Theelke3
1Department of Animal Biosciences, Swedish University of Agricultural Sciences, Uppsala, Sweden. jnoh0002@stud.slu.se.
BMC veterinary research
|June 22, 2024
概括
在瑞典对马类疹病毒1 (EHV-1) 的基因分析显示了14种基因变异,其中一种是主导菌株. 确定了新的突变,并澄清了EHV-1传播动态,包括恢复马的疫情后脱落.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 马类传染病 马类传染病
- 分子流行病学分子流行病学
背景情况:
- 马类疹病毒1 (EHV-1) 是全球马类疾病的主要原因,包括神经系统疾病,如马类疹髓脑病变 (EHM).
- 瑞典关于流通的EHV-1菌株的数据有限,尽管瑞典的疾病地位是必须报告的疾病.
研究的目的:
- 为了调查瑞典EHV-1菌株的遗传多样性.
- 分析与2012年至2021年爆发相关的EHV-1的遗传构成和传播模式.
主要方法:
- 来自55个瑞典疫情的EHV-1部分基因组测序.
- 基于开放式读取框架ORF11,ORF30和ORF34.4的基因型鉴定.
- 新型突变的识别和表征.
主要成果:
- 发现了14种不同的EHV-1基因变体,其中一种流行变体在49%的疫情中被发现.
- 鉴定了七种新型突变,包括ORF11和ORF34.4中的同名和非同名变化.
- 在EHM疫情中检测出多种EHV-1基因变异,有证据表明疫情中的克隆传播.
- 在国际 EHM 疫情爆发后,在康复的马匹中展示病毒流放.
结论:
- 这项研究强调了瑞典EHV-1的显著遗传多样性.
- 这些发现为EHV-1传播动态提供了关键的见解,包括持续流失的可能性.
- 这项研究有助于更好地了解瑞典和全球的EHV-1流行病学.
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