用SLAF-seq和BSR-seq分析绘制狐尾小米中菌耐药性的QTL映射
Xu Liu1,2, Nuo Zhang1,2, Yurong Sun1,2
1College of Plant Protection, Shanxi Agricultural University, Taigu, 030801, Shanxi, China.
概括
研究人员确定了三个主要的定量特征位点 (QTLs),用于在狐尾小米中抵抗菌,位于8号染色体上. 这一发现有助于培育对抗这种破坏性疾病的更有弹性作物.
科学领域:
- 植物遗传学 植物遗传学
- 农作物科学 农作物科学
- 分子育种是一种分子育种.
背景情况:
- 梅花 (由Sclerospora graminicola引起) 显著降低了狐尾小米的产量和质量.
- 开发耐药的狐尾小米品种至关重要,但耐药性的分子标记物很少.
研究的目的:
- 识别和绘制与狐尾小米中菌耐药性相关的定量特征位点 (QTL).
- 为了精确确定为标记器辅助繁殖赋予耐药性的候选基因.
主要方法:
- 使用158个F6:7重组杂交系 (RILs) 构建一个高密度链接地图.
- 全基因组关联研究 (GWAS) 和散装分离剂分析测序 (BSR-seq) 以确定QTLs.
- 哈普洛型和对线性分析以确定候选耐药性基因.
主要成果:
- 通过使用高密度链接地图,确定了9个耐菌的QTL.
- 三个主要的QTL被定位在8号染色体上的0.78Mb间隔,含有10个NBS-LRR基因.
- 在特定基因中的九个SNP位点 (Seita8G.199800,Seita8G.195900,Seita8G.198300,Seita.8G199300) 与疾病耐药性有显著的相关性.
结论:
- 已识别的QTL和候选基因为培育耐药狐尾小米品种提供了宝贵的资源.
- 这项研究有助于我们更好地理解在狐尾小米中抗菌的基因机制.
