在量化循环中预测糖尿病末期脏疾病的miRNA时的分析前考虑

科学领域:

• 生物化学 生化学
• 分子生物学分子生物学
• 腎臟病學 (nephrology) 是一種醫學專業.

背景情况:

• 之前的研究已经确定了与糖尿病患者末期病 (ESKD) 进展相关的特定血微RNA (miRNA).
• 了解预分析因素对于准确的循环miRNA量化至关重要.

研究的目的:

• 调查预分析因素如何影响循环miRNAs的检测和量化.
• 为了比较全血中的miRNA分析与使用不同平台提取的RNA.

主要方法:

• 使用EdgeSeq平台量化了2,002个血miRNAs.
• 从同一样本中提取的RNA与全血中的miRNA资料进行了比较.
• 在EdgeSeq,RNA测序 (RNA-Seq) 和定量逆转录PCR (qRT-PCR) 平台上评估了miRNA检测和度.

主要成果:

• 在标准RNA提取中检测到的miRNA不到一半.
• 与EdgeSeq.的全血相比,RNA提取导致了显著较低的miRNA检测和度.
• EdgeSeq平台表现出极好的可重复性,不受年龄,性别,HbA1c,BMI或冷存储的影响.
• 仅在全血中使用EdgeSeq.精确检测到与ESKD相关的风险miRNA.
• 保护性ESKD小RNAs在不同平台 (除了qRT-PCR) 的度中显示出微弱或没有相关性.

结论:

• 在糖尿病病中,预分析变量对循环miRNA检测和量化有深远的影响.
• 通过EdgeSeq平台量化全血中的miRNAs建议用于研究ESKD相关的无细胞miRNA配置文件.