基因组挖掘用于新的抗生素
Esther J Han1, Mohammad R Seyedsayamdost2
1Department of Chemistry, Princeton University, Princeton, NJ 08544, USA.
Current opinion in chemical biology
|June 25, 2024
概括
通过对静态生物合成基因集群 (BGC) 的先进查和操纵,正在发现新型抗生素,强大的DNA分裂化合物. 这释放了大自然的化学创造力,用于新药的开发.
科学领域:
- 自然产品化学 自然产品化学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 恩迪恩抗生素是复杂的天然产品,具有强大的DNA分裂活性.
- 微生物基因组含有众多生物合成基因集群 (BGCs),但许多基因保持沉默或表达不充分.
- 尽管BGCs丰富,但已有不到二十个enediyne天然产品的特征.
研究的目的:
- 审查最近的发现新兴天然产品的策略.
- 突出克服进入无声 BGC 的挑战的方法.
- 强调新发明发现的潜力,并了解它们的生物合成.
主要方法:
- 从罕见的微生物来源进行表型查.
- 对BGCs进行生物合成操纵.
- 基于基因组签名的PCR查.
- 结合高通量诱导体选的DNA裂变试验,以寻找无声的BGC激活.
主要成果:
- 识别了四种不同的战略,用于新型的Erediyne发现.
- 展示获取以前未被描述的数据的方法.
- 强调将基因组数据与功能测试相结合的成功.
结论:
- 新兴的方法正在有效地解锁enediyne BGCs的庞大储备.
- 新的天然产品即将出现,并进一步深入了解它们的生物发生.
- 大自然在enediynes中的化学创造力越来越容易被科学探索.
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