基因组条形编码用于基于细胞的复杂抗体生产中的克隆多样性监测和控制

科学领域:

• 生物技术和基因工程 生物技术和基因工程
• 哺乳动物细胞系的发展.
• 基因组学和分子生物学

背景情况:

• 工程哺乳动物细胞对生物技术至关重要,作为体外模型和治疗生物工厂.
• 现有的细胞系在子系中表现出显著的遗传和表型异质性,对其起源和影响的理解有限.
• 克隆间异质性可能会影响生物技术应用中工程细胞系的性能和一致性.

研究的目的:

• 开发一种基因组条码策略,用于基于目标集成 (TI) 的中国子卵巢 (CHO) 抗体生产细胞系 (CLD) 的基因组条码策略.
• 在稳定细胞系选择和单克隆性评估过程中了解克隆多样性.
• 通过监测细胞系来改善高性能抗体生产克隆的选择.

主要方法:

• 开发了一种基因组条码策略,用于基于TI的CHO细胞系开发.
• 应用条形码来评估池级和单细胞克隆后的克隆多样性.
• 在整个CLD过程中监测细胞系,以改善克隆选择.
• 使用条形码数据分析了种群动态和克隆变异.

主要成果:

• 在TI产生的CHO生产者池中观察到的多样性很低,在种植过程中迅速倾向于主导克隆.
• 确定来自单一TI事件的克隆细胞系在生产参数中的差异较小,而不是来自不同的TI事件的生产参数.
• 证明大多数克隆变异源于先前存在的细胞内在因素,而不是CLD过程本身.
• 展示了使用蜂条码改进的CLD查工作流程和丰富的生产参数多样性.

结论:

• 工程细胞系中的细胞多样性在很大程度上取决于细胞内在因素,而不是细胞系发育过程.
• 基因组条形码为克隆多样性提供了新的见解,使成像独立的单克隆性评估成为可能.
• 这种条形码策略增强了抗体生产克隆的选择能力,并促进了数据驱动的CLD过程.
• 开发的技术为经济上有价值和受控制的细胞系开发铺平了道路.