来自大米根的内性亚松菌群落是多样化的,与土壤亚松菌群落组成和土壤性质的联系很弱
Lucía Ferrando1, Gastón Rariz1, Andrea Martínez-Pereyra1
1Laboratorio de Ecología Microbiana Medioambiental, Área Microbiología, Departamento de Biociencias, Facultad de Química, Universidad de la República, General Flores 2124, Montevideo, Uruguay.
Journal of applied microbiology
|June 26, 2024
概括
土壤的亚热菌很少殖民米根,其中的内菌群体显示出不同的微生物组成. 这突出了在米种植中促进植物生长的细菌独特的根植殖模式.
科学领域:
- 微生物生态学 微生物生态学
- 植物与微生物的相互作用
- 农业微生物学 农业微生物学
背景情况:
- 促进植物生长的细菌,特别是类植物,对于可持续农业至关重要,特别是在米等非豆类作物中.
- 识别与植物相关的新型微生物对于提高作物生产率和减少对合成肥料的依赖至关重要.
- 了解土壤到根的微生物转移是利用有益细菌促进植物生长的关键.
研究的目的:
- 调查土壤二氧菌对大米根内菌群体的贡献.
- 分析乌拉圭土壤和大米植物根中的分类学多样性和分发.
- 为了在受控条件下比较土壤中的二氧菌群落与那些殖民大米根的群体.
主要方法:
- 分析了乌拉圭7个代表性土壤的土壤样本.
- 用定量PCR (qPCR),终端限制片段长度多态化 (T-RFLP) 和nifH基因的454-pyrosequencing来评估土壤和大米根中的Diazotroph社区.
- 在受控条件下,从相同基因型的种子中,在25天内种植大米苗.
主要成果:
- 在土壤,根和叶子中观察到类似的nifH基因丰度.
- 在根部比在土壤中分布的差异明显大,在根部占优势的指数更高.
- 主导的土壤双菌主要是Alphaproteobacteria和Planctomycetota,而根源则包含不同的社区,包括Alpha,Beta,Gammaproteobacteria和Bacillota,通常在土壤中无法检测到. 在土壤和根社区之间的nifH序列中发现了最小的重叠.
结论:
- 根内性亚松菌群体与它们的源土壤中存在的亚松菌群体相比,表现出更广泛的分类学多样性.
- 米根显示出强烈的,特定的植民模式,用于内性亚类植物,与周围的土壤微生物群不同.
- 这些发现表明,根内生植物性双菌不仅来自大土,这意味着有选择性的殖民过程.
