综合体复合子单元的综合生物信息学分析:表达模式,免疫透和预后特征,通过实验方法在肝细胞癌中验证
Yifei Xu1, Wenlian Liao1, Ting Wang1
1Institute of Interdisciplinary Integrative Medicine Research, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai, 201203, China.
Discover oncology
|June 26, 2024
概括
整合体复合体 (INTS) 基因在肝细胞癌 (HCC) 中被上调,显示出诊断和预后价值. 针对这些INTS基因可能为HCC患者提供新的治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 由于其高发病率和不良预后,对全球健康构成了重大挑战.
- 整合器复合体 (INTS) 子单元与RNA聚合酶II调节有关,这表明它可能在癌症发展中发挥作用.
- INTS家族基因在HCC病变发生中的特定参与仍然在很大程度上未被探索.
研究的目的:
- 综合调查INTS家族基因在肝细胞癌 (HCC) 中的临床意义和潜在作用.
- 用生物信息学方法分析INTS基因在HCC中的表达模式,诊断价值,预后影响和与免疫相关的功能.
主要方法:
- 使用公共数据库 (UALCAN,HPA,Kaplan-Meier Plotter,GEPIA2,TNMplot,STRING,TIMER,TISIDB) 来进行表达,相关性和免疫透分析.
- 进行了基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 路径丰富分析.
- 通过西部斑块,RT-qPCR,免疫组织化学和细胞增殖试验 (CCK8) 验证的结果.
主要成果:
- 在HCC中,INTS1,INTS4,INTS7和INTS8在转录和蛋白质水平上显著上调.
- 这些INTS基因的过度表达与晚期瘤相相关,并证明了诊断和预后价值.
- INTS基因表达与免疫细胞透和与癌症相关的信号通路的激活有关 (例如, TRAIL, mTOR, p53).
- 抑制INTS1降低了HCC细胞的增殖.
结论:
- 在HCC中,INTS家族基因,特别是INTS1,INTS4,INTS7和INTS8作为有前途的诊断生物标志物.
- 这些INTS基因代表了HCC治疗的潜在治疗点.
- 需要进一步的机制研究来探索INTS基因在HCC管理中的临床应用.
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