人类卵细胞的单细胞RNA测序揭示了与甲状的 zona pellucida 相关的差异性转录基因特征
Xiangyang Zhang1, Senlin Shi2, Ying Wan2
1Reproductive Medical Center, Henan Province Key Laboratory for Reproduction and Genetics, First Affiliated Hospital of Zhengzhou University, Zhengzhou, Henan, People's Republic of China. zhxyangtian@126.com.
Journal of ovarian research
|June 26, 2024
概括
类似阿加的 zona pellucida (ZP) 与不孕症有关. 这项研究使用单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 揭示卵细胞中的分子变化,识别与细胞外基因矩阵和DNA损伤反应相关的改变基因表达.
科学领域:
- 生殖生物学 生殖生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 分子医学是分子医学.
背景情况:
- 类似阿加的 zona pellucida (ZP) 是不孕不育的常见原因.
- 亚格类ZP背后的分子机制仍然不太清楚.
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 用于研究卵子细胞的分子格局,这些卵子细胞具有类似 agar的ZP.
研究的目的:
- 为了阐明类似 agar的ZP形成的分子机制.
- 为了识别异性表达的基因和途径在卵子细胞与样ZP.
- 了解阿加样ZP对卵细胞质量和生育能力的影响.
主要方法:
- 人类元相I (MI) 卵细胞从患有亚格样ZP的患者和健康的捐赠者中收集.
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 在孤立的卵细胞上进行.
- 生物信息分析,包括基因本体学和基因和基因组路径丰富的京都百科全书,使用R.软件进行.
主要成果:
- 在亚格样ZP和健康卵细胞之间确定了1320个不同表达的基因.
- 下调的基因与细胞外矩阵组织有关,而上调的基因与DNA损伤反应有关.
- 确定的主要途径包括ECM受体相互作用,焦点粘附和PI3K-Akt信号传递. UBC,TLR4和RELA是已识别的遗传标记物之一.
结论:
- 类似阿加的ZP卵细胞显示ECM受体相互作用和焦点粘附通路的下调,可能导致异常ZP形成.
- 亚格类ZP卵细胞中的上调基因与DNA损伤反应有关.
- 异常的ZP形成可能会扰乱卵细胞-花质细胞信号传输,损害DNA修复,导致卵细胞成熟停止.
