在Xtract-FreeTM样本采集和运输介质中用于RNase无活化的aptamers的开发

科学领域:

• 生物技术是生物技术.
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• RNA非常容易被核糖核酶 (RNase) 酶降解.
• 目前的样本采集方法通常需要冷链或即时处理,限制了可访问性.
• 需要稳定,用户友好的样本采集媒介用于基因分析.

研究的目的:

• 开发针对RNase A.的新型DNA吸收体.
• 为了将这些体集成到一种无提取的收集介质中,以保存RNA.
• 为了评估阿普他默介导的RNase失活的疗效.

主要方法:

• 通过指数丰富的连接体系统进化 (SELEX) 用于生成抗RNase DNA 体.
• 使用偏磁珠和严格的条件选择了aptamers,包括一种新的收集介质 (Xtract-FreeTM) 和高温.
• 下一代测序和生物信息分析确定了五个候选的体.
• 用度和实时RT-PCR测定来量化RNase活性来评估RNA完整性.

主要成果:

• 成功生成和识别了具有抗RNase活性的五种DNA体.
• 加入阿普坦酶使RNase活性降低了8,800至11,200倍,显著保护病毒RNA免受消化.
• 在模拟家庭采集场景的条件下,开发的aptamer保持了有效性.

结论:

• 抗RNase DNA 体可以有效地禁用RNase 酶,从而保持RNA的完整性.
• 这些体适合集成到无提取样本采集介质和诊断套件中.
• 这项技术具有很大的潜力,可以提高基于RNA的基因组分析的质量和可访问性,特别是对照料点和邮件回复测试.