使用相关的元分析发现功能和先进糖化终产品的可溶性受体之间的基因组和转录基因组性:长寿家庭研究:长寿家庭研究
Mary F Feitosa1, Shiow J Lin1, Sandeep Acharya2
1Division of Statistical Genomics, Department of Genetics, Washington University in St Louis School of Medicine, St. Louis, Missouri, USA.
Aging cell
|June 27, 2024
概括
影响功能和衰老的遗传因素是共同的. 这项研究确定了共享的类基因位点和基因表达,用于估计的膜过率 (eGFR) 和高级糖化最终产品 (sRAGE) 的可溶性受体.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 腎臟病學 (nephrology) 是一種醫學專業.
- 衰老研究研究 衰老研究
背景情况:
- 慢性病 (CKD) 与氧化应激,炎症和先进的糖化最终产品 (AGEs) 有关.
- 高可溶性AGE受体 (sRAGE) 和低估计的球膜过率 (eGFR) 与CKD和衰老有关.
- 了解共同的遗传因素可能会揭示新的治疗点.
研究的目的:
- 为了调查eGFR和sRAGE之间共享的类基因因素.
- 为了确定与功能和sRAGE水平相关的特定基因和位置.
主要方法:
- 全基因组测序和全基因组关联研究 (GWAS) 的元分析来自4182个人的数据 (长寿家庭研究).
- 从1209个人的全血中进行的全转录组关联研究 (TWAS).
- 基因组注释和转录基因活动的整合.
主要成果:
- 确定了59个类GWAS位点和17个TWAS基因,用于eGFR和sRAGE.
- 发现了特定的基因 (LSP1,MIR23AHG) 和基因位点 (lncRNA-KCNQ1OT1,CACNA1A/CCDC130) 将eGFR与sRAGE联系起来.
- GWAS变体和TWAS基因在脏组织中表达了定量特征位点 (eQTL) 效应,并预测了癌.
- 在LLFS队列中,对eGFR的保护变异更频繁,这表明健康衰老中功能更好.
结论:
- 共享的遗传效应是eGFR和sRAGE的基础,这意味着它们在脏和衰老途径中的作用.
- 类基因位点和基因表达突出显示了病和衰老中潜在的共同机制.
- 研究结果提供了对功能和衰老的遗传结构的见解.
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