在资源有限和资源丰富的环境中,比较使用临床数据和COVID-19的细胞因子概况的机器学习查方法
Hooman H Rashidi1, Aamer Ikram2, Luke T Dang3
1Computational Pathology and AI Center of Excellence (CPACE), University of Pittsburgh Medical Center, and University of Pittsburgh School of Medicine, Pittsburgh, USA. rashidihh@upmc.edu.
Scientific reports
|June 27, 2024
概括
机器学习模型使用临床数据和细胞因子概况在症状患者中准确地选COVID-19 (冠状病毒疾病2019). 这种方法为缺乏传统测试能力的资源有限的环境提供了可靠的解决方案.
科学领域:
- 计算生物学是一种计算生物学.
- 传染病流行病学 传染病流行病学
- 机器学习在医疗保健中的应用
背景情况:
- 准确的COVID-19查对公共卫生至关重要,特别是在资源有限的环境中,测试很少.
- 流行病的早期阶段缺乏足够的诊断工具,突出了需要可访问的查方法.
研究的目的:
- 开发和评估机器学习 (ML) 模型,以快速和可靠的COVID-19查.
- 评估使用临床数据,细胞因子概况或组合进行分类的疗效.
- 为开发新兴传染病查工具提供概念验证.
主要方法:
- 自动化的ML方法来训练和评估数千个模型.
- 使用了临床数据集 (n=150),包括临床,实验室和细胞因子数据.
- 在非样本二次数据集 (n=120) 上验证的模型.
主要成果:
- 使用三种数据方法开发了用于COVID-19阳性/阴性分类的ML模型.
- 所有测试的模型都显示了>92%的灵敏度和>88%的特异性.
- 性能最高的模型实现了95.6%的灵敏度和98.1%的特异性.
结论:
- 在资源有限的环境中,ML模型为COVID-19分类提供了潜在的有效解决方案.
- 这种方法证明了开发新型传染病快速查工具的可行性.
- 该研究表明,用于疾病查的常见数据和细胞因子概况的有用性.
关键词:
二进制分类器二进制分类器在 COVID-19 疫情中,CTACK (CCL27) 是一个类型.化学因子 (chemokines) 是一种化学物质.细胞因子 (cytokines) 是一种细胞因子.毒素 (CCL11) 是一种财政预算基础基金 (FGF2)在G-CSF (CSF3) 中.转基因-CSF (CSF2) 是一个转基因-CSF.在GRO-α (CXCL1) 中.在HGF的基础上.在IFN-α2 (IFNA2) 中.国际货币基金组织-γ (IFNG)IL-12 (p40) (IL12B) 是一种可靠的药物.IL-12 (p70) (IL12A) 是一种可靠的药物.它们的IL-18 (IL18) 类型.在IL-1ra (IL1RN) 中.在IL-1α (IL1A) 中.在IL-1β (IL1B) 中.它们的IL-2Rα (IL2RA) 基因.IL10 IL10 已经开始了IL13 IL13 IL13 IL13 IL13 IL13 IL13 IL13 IL13 IL13 IL13在 IL15 中,IL15 是 IL15 的代号.IL16 IL16 IL16 IL16 IL16 IL16 IL16 IL16 IL16 IL16在 IL17A 中.IL2 IL2 IL2 IL2 IL2 IL2 IL2 IL2 IL2 IL2IL3 IL3 IL3 IL3 IL3 IL3 IL3 IL3 IL3 IL3 IL3IL4 IL4 IL4 IL4 IL4 IL4 IL4 IL5 IL6 IL7 IL8 IL9 IL9IL5 IL5 IL5 IL5 IL5 IL5 IL5 IL5 IL5 IL5 IL5在IL6 IL6 IL6 IL6 IL6在IL7中,IL7是IL7.IL8 (CXCL8) 是一种IL9 IL9 IL9 IL9 IL9 IL9 IL9 IL9 IL9 IL9IP-10 (CXCL10) 是一个一个LIF就是一个LIF.在M-CSF (CSF1) 中.在MCP-1 (MCAF) (CCL2) 中.在MCP-3 (CCL7) 中.多元期权基金和多元期权基金.MIG (CXCL9) 是一个在MIP-1α (CCL3) 中.在MIP-1β (CCL4) 中.机器学习是机器学习.这是PDGF-BB (PDGFB).兰特斯 (CCL5) 公司在SCF (KITLG) 中.在SCGF-β (CLEC11A) 中.在SDF-1α (CXCL12) 中.这就是TNF-α.在TNF-β (LTA) 中.一条轨道 (TNFSF10)维格法 (VEGFA) 是一种植物.β-NGF (NGF) 是一种天然气.
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