通过SARS-CoV-2的分析来教授生物信息学:为计算机科学学生提供基于项目的培训
Pavlin G Poličar1, Martin Špendl1, Tomaž Curk1
1Faculty of Computer and Information Science, University of Ljubljana, Večna pot 113, 1000 Ljubljana, Slovenia.
Bioinformatics (Oxford, England)
|June 28, 2024
概括
实践生物信息学作业通过经验增强学习. 学生分析基因组学数据,包括SARS-CoV-2,以了解生物概念和病毒反应,确认方法的方法.
科学领域:
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 基因组学教育 基因组学教育
背景情况:
- 有效的学习强调经验和反思,而不是被动地接收信息.
- 生物信息学为基于项目的学习提供了一个丰富的环境,使用丰富的开放访问分子数据.
- 重新分析生物数据可以重新发现关键概念.
研究的目的:
- 为士计算机科学学生设计和评估五个实践生物信息学作业.
- 培训学生在基因组生物信息学使用现实世界的数据,特别是专注于SARS-CoV-2.
- 通过数据分析促进对基因组,基因,病毒关系和宿主反应的学习.
主要方法:
- 开发一个入门生物信息学课程的五个基于项目的任务.
- 任务需要编程技能,但没有先前的分子生物学知识.
- 专注于分析与严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 相关的基因组数据.
主要成果:
- 任务成功培训学生在基因组学生物信息学.
- 学生了解基因组,基因,病毒进化和免疫反应.
- 学生的评价表明高有用性,适当的难度和吸引人的内容.
结论:
- 基于项目的生物信息学作业对于科学教育是有效的.
- 开发的课程材料为教学基因组学和生物信息学提供了宝贵的资源.
- 自由可用的 GitHub 存储库有助于实现和更广泛的采用.
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