来自人类受试者和动物模型的便样本的元蛋白质组分析
Alessandro Tanca1, Antonio Palomba2
1Department of Biomedical Sciences, University of Sassari, Sassari, Italy. aletanca@uniss.it.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
|June 28, 2024
概括
便形蛋白学为肠道微生物和宿主蛋白质的变化提供了洞察力. 本协议详细分析了人类和动物的便甲蛋白质组,用于功能通路的研究.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 胃肠病学 胃肠病学
背景情况:
- 肠道微生物群对宿主健康起着至关重要的作用.
- 了解微生物和宿主蛋白质的表达是阐明肠道功能的关键.
- 便甲蛋白组学为肠道内的活跃生物功能提供了一个窗口.
研究的目的:
- 描述便元蛋白质组分析的综合性协议.
- 为了使便样本中的微生物和宿主蛋白质能够进行表征.
- 为了促进涉及肠道微生物群的功能途径的识别.
主要方法:
- 使用机械和热处理提取蛋白质.
- 以离心器过器为基础的清洁和酶性消化.
- 通过长梯度液态色谱来分离.
- 使用高分辨率质谱测量检测.
主要成果:
- 该协议已成功应用于人类,老鼠和老鼠便样本.
- 它可以测量微生物和宿主蛋白质的丰度.
- 允许推断微生物参与特定的功能和途径.
结论:
- 描述的便元蛋白组学协议是强大的和多功能.
- 它是研究肠道微生物组的组成和功能的一个有价值的工具.
- 这种方法有助于理解宿主微生物相互作用和代谢途径.
