慢性淋巴结膜炎中介血管细胞衍生CircRNAs:RNA测序和生物信息学分析
Ji Hui Fan1, Xiao Min Li1,2
1Department of Nephrology, Huaibei People's Hospital, Huaibei, China.
Renal failure
|July 1, 2024
概括
这项研究揭示了中细胞中关键的循环RNAs (circRNAs),这些细胞参与慢性淋巴结核炎 (CGN) 病原发生. 这些circRNAs影响免疫反应和炎症途径,为CGN发育提供了新的见解.
科学领域:
- 腎臟病學 (nephrology) 是一種醫學專業.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 慢性淋巴结膜炎 (CGN) 的发病过程涉及循环RNAs (circRNAs),但它们在介质细胞中的特定作用尚不清楚.
- 了解介质细胞衍生的circRNAs对于阐明CGN机制至关重要.
研究的目的:
- 探索介质细胞衍生的circRNAs在CGN病变发生中的功能.
- 在CGN中识别关键的circRNA及其相关分子通路.
主要方法:
- 建立了一个体外CGN模型,使用脂聚糖 (LPS) 刺激的小鼠介质细胞 (MMCs).
- 使用RNA测序 (RNA-seq) 来识别差异表达的circRNAs (DE-circRNAs) 和mRNAs (DE-mRNAs).
- 使用了权重基因共同表达网络分析 (WGCNA),CeRNA网络构建,LASSO,GO,KEGG,GSEA和CIBERSORT进行全面的生物信息学分析.
主要成果:
- 在LPS刺激增加了促炎性细胞因子,并在MMC中改变了细胞周期进展.
- 确定了4个上调和2个下调的DE-circRNA和1747个与CGN相关的DE-mRNA.
- 构建了一个CeRNA网络,揭示了参与免疫和炎症途径的枢纽mRNA (BOC,MLST8,HMGCS2),与特定免疫细胞相关.
结论:
- 介质细胞衍生的circRNAs在CGN病变发生中发挥着重要作用.
- 确定了关键的circRNA及其相关的炎症和免疫通路,为CGN研究提供了新的见解.
